نرم افزار HADDOCK
بعنوان یک روش داک کردن مبتنی بر اطلاعات مدل های پیچیده بیومولکول می باشد. HADDOCK اطلاعاتش را بر اساس نواحی وجه به وجه پروتئین- پروتئین (interface Protein_Protein) و اندرکنش های مبهم پیش […]
بعنوان یک روش داک کردن مبتنی بر اطلاعات مدل های پیچیده بیومولکول می باشد. HADDOCK اطلاعاتش را بر اساس نواحی وجه به وجه پروتئین- پروتئین (interface Protein_Protein) و اندرکنش های مبهم پیش […]
ساختار سه بعدی پایدارترین پپتید ها با نرم افزار Hyperchem 7 ( شرکت Hypercube) پیشگویی می شوند. در این نرم افزار ساختار های حاصل با استفاده از روش دینامیک مولکولی از لحاظ
PyMol یک نرم افزار کامپیوتری برای نمایش سیستم های مولکولی می باشد که توسط Warren Lyford DeLano ایجاد شده است. این نرم افزار ، متن باز Open source می باشد و تحت
Desmond : شبیه ساز دینامیک مولکولی راندمان بالا سیستم های تغلیظ شده فاز در اصل دینامیک هستند، لذا آنالیز حرکت های آنها در سطح مولکولی و اتمی برای فهم خصوصیات physicochemical بسیار
محیط مدلسازی مولکولی همه کاربرده Maestro نرم افزاری است که همه تکنولوژی های محاسباتی Schrödinger را شامل می شود. این نرم افزار تنها یک پنجره کاربری نمی باشد بلکه به محققین کمک
Docking یک ترم است که تعداد زیادی از الگوریتم های پیچیده را شامل می شود که مکان یابی مناسب لیگاندهای rigid و flexible در binding site گیرنده را پیدا می کند. لیگاندها
سرفصل بخش ها : بخش 1 : ایجاد فایل mol با نرم افزار Marvin Sketch بخش 2 : ایجاد فایل mol برای docking بخش 3 : نصب autodock vina بخش 4 :
آموزش نرم افزارهای Marvin Sketch autodock vina بیشتر بخوانید »