آموزش فارسی Desmond

Desmond : شبیه ساز دینامیک مولکولی راندمان بالا 

سیستم های تغلیظ شده فاز در اصل دینامیک هستند، لذا آنالیز حرکت های آنها در سطح مولکولی و اتمی برای فهم خصوصیات physicochemical بسیار مهم هستند.

در طول چند دهه، علاقه بسیار زیادی در مدلسازی سیستم های مختلف دینامیکی در علم زندگی و علم مواد وجود داشته است. این سیستم ها شامل مجتمع پروتئین لیگاند و مولکول های کوچک در حلالهای ترکیبی و مواد جامد ارگانیک و مجتمع ماکرومولکولی مصنوعی می باشند.

دینامیک مولکولی (MD) به عنوان یک ابزار محاسباتی پایه برای استخراج رویدادهای پویا از دید عملی در همه کاربردها شناخته می شود.

اخیرا روشهای استاتیک ساختار مبنا، مانند docking و نمایش مجازی ، در کشف دارو بسیار مهم شده اند. دینامیک مولکولی هنگامی که با ابزارهای محاسباتی دیگر کوپل شود، باعث می شود بسیاری از مشکلات کشف داروهای جدید برطرف شود.

آماده سازی غشای پروتئین برای شبیه سازی MD
آماده سازی پروتئین برای شبیه سازی MD
نمایش مسیر حرکت MD و ایجاد یک فیلم
آنالیز مسیر حرکت MD با دیاگرام شبیه سازی تعاملی
بارگذاری داده
PL-RMSD
P-RMSF
L-RMSF
PL-Contacts
LP-Contacts
L-Torsions
تولید گزارش

لینک دانلود

پیش نمایش 1 :

لینک آپارات
لینک یوتیوب

پیش نمایش 2 :

لینک آپارات
لینک یوتیوب